MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Aggregatibacter aphrophilus NJ8700 chromosome

Total Repeats: 7625

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_012913	A	6	6	2262952	2262957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7502	NC_012913	CAAAAT	2	12	2263000	2263011	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7503	NC_012913	ATTAA	2	10	2263037	2263046	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7504	NC_012913	TTG	2	6	2263053	2263058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7505	NC_012913	AAAT	2	8	2263081	2263088	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7506	NC_012913	ATT	2	6	2263107	2263112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7507	NC_012913	TAT	2	6	2263249	2263254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7508	NC_012913	GTTT	2	8	2263316	2263323	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7509	NC_012913	CTTA	2	8	2265215	2265222	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7510	NC_012913	TGA	2	6	2267089	2267094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7511	NC_012913	GA	3	6	2267099	2267104	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7512	NC_012913	A	6	6	2267154	2267159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7513	NC_012913	TAAT	2	8	2267407	2267414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7514	NC_012913	T	7	7	2268676	2268682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7515	NC_012913	TTCA	2	8	2268691	2268698	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7516	NC_012913	AAC	2	6	2269593	2269598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7517	NC_012913	TTGAT	2	10	2269604	2269613	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7518	NC_012913	T	8	8	2269623	2269630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7519	NC_012913	A	6	6	2271743	2271748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7520	NC_012913	TGA	2	6	2272907	2272912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7521	NC_012913	TTAT	2	8	2272923	2272930	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7522	NC_012913	T	6	6	2272934	2272939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7523	NC_012913	TTA	2	6	2273824	2273829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7524	NC_012913	AAT	2	6	2273835	2273840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7525	NC_012913	T	6	6	2273847	2273852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7526	NC_012913	ACC	2	6	2273878	2273883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7527	NC_012913	TAAG	2	8	2273904	2273911	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7528	NC_012913	TGT	2	6	2274899	2274904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7529	NC_012913	T	8	8	2274914	2274921	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7530	NC_012913	T	6	6	2275711	2275716	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7531	NC_012913	GAA	2	6	2276834	2276839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7532	NC_012913	T	6	6	2276864	2276869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7533	NC_012913	T	6	6	2277519	2277524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7534	NC_012913	CTTA	2	8	2279085	2279092	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7535	NC_012913	GTG	2	6	2279831	2279836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7536	NC_012913	AATATG	2	12	2279868	2279879	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7537	NC_012913	ATT	2	6	2279898	2279903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7538	NC_012913	T	7	7	2279954	2279960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7539	NC_012913	TAA	2	6	2280047	2280052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7540	NC_012913	TGA	2	6	2280142	2280147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7541	NC_012913	TTA	2	6	2280174	2280179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7542	NC_012913	A	7	7	2280200	2280206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7543	NC_012913	AAAT	2	8	2280219	2280226	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7544	NC_012913	ATA	2	6	2280239	2280244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7545	NC_012913	ATT	2	6	2280283	2280288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7546	NC_012913	TGA	2	6	2280291	2280296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7547	NC_012913	A	8	8	2280308	2280315	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7548	NC_012913	AG	3	6	2280353	2280358	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7549	NC_012913	AATT	2	8	2280381	2280388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7550	NC_012913	ATA	2	6	2280402	2280407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7551	NC_012913	TA	3	6	2280472	2280477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7552	NC_012913	CAA	2	6	2280491	2280496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7553	NC_012913	AAG	2	6	2280517	2280522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7554	NC_012913	ATT	2	6	2280531	2280536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7555	NC_012913	GAT	2	6	2280539	2280544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7556	NC_012913	ATT	2	6	2280549	2280554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7557	NC_012913	TTG	2	6	2280573	2280578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7558	NC_012913	TCT	2	6	2280647	2280652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7559	NC_012913	TAA	2	6	2280688	2280693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7560	NC_012913	TCAA	2	8	2280724	2280731	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7561	NC_012913	A	6	6	2280733	2280738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7562	NC_012913	ATA	2	6	2280766	2280771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7563	NC_012913	GTTA	2	8	2281067	2281074	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7564	NC_012913	T	6	6	2281235	2281240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7565	NC_012913	ATTTT	2	10	2281287	2281296	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7566	NC_012913	T	6	6	2282936	2282941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7567	NC_012913	AATTTT	2	12	2283994	2284005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7568	NC_012913	TAT	2	6	2286900	2286905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7569	NC_012913	T	7	7	2286905	2286911	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7570	NC_012913	ATT	2	6	2286921	2286926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7571	NC_012913	AGGA	2	8	2288398	2288405	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7572	NC_012913	GC	3	6	2288432	2288437	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7573	NC_012913	T	6	6	2288988	2288993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7574	NC_012913	T	6	6	2289735	2289740	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7575	NC_012913	GGCG	2	8	2291247	2291254	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7576	NC_012913	TTA	2	6	2291284	2291289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7578	NC_012913	TGT	2	6	2293269	2293274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7581	NC_012913	TGT	2	6	2294251	2294256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7583	NC_012913	T	7	7	2294791	2294797	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7584	NC_012913	T	6	6	2294803	2294808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7585	NC_012913	GTA	2	6	2295464	2295469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7587	NC_012913	CT	3	6	2298067	2298072	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7588	NC_012913	TTAA	2	8	2298077	2298084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7589	NC_012913	ATG	2	6	2299735	2299740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7592	NC_012913	TAT	2	6	2299809	2299814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7593	NC_012913	TACT	2	8	2299819	2299826	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7594	NC_012913	TA	3	6	2299832	2299837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7595	NC_012913	ATA	2	6	2300584	2300589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7596	NC_012913	AAT	2	6	2300656	2300661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7597	NC_012913	TAT	2	6	2300672	2300677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7598	NC_012913	ATT	2	6	2305034	2305039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7599	NC_012913	T	6	6	2305054	2305059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7600	NC_012913	GTC	2	6	2305849	2305854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7601	NC_012913	GAA	2	6	2306205	2306210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7602	NC_012913	CTTTT	2	10	2306236	2306245	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7603	NC_012913	T	6	6	2306242	2306247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7604	NC_012913	ATT	2	6	2306380	2306385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7605	NC_012913	GC	3	6	2308237	2308242	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7606	NC_012913	AATA	2	8	2308245	2308252	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7607	NC_012913	T	6	6	2308257	2308262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7608	NC_012913	ATCGGT	2	12	2309631	2309642	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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7610	NC_012913	CTA	2	6	2309715	2309720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7611	NC_012913	A	8	8	2309720	2309727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7612	NC_012913	A	6	6	2310994	2310999	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7613	NC_012913	GAA	2	6	2311003	2311008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7614	NC_012913	T	8	8	2311749	2311756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7615	NC_012913	TTA	2	6	2311776	2311781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7616	NC_012913	TCCAA	2	10	2311835	2311844	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
7617	NC_012913	ATT	2	6	2311900	2311905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7618	NC_012913	ATT	2	6	2312305	2312310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7619	NC_012913	CAA	2	6	2312759	2312764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7620	NC_012913	TTC	2	6	2312786	2312791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7621	NC_012913	GTT	2	6	2312839	2312844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7622	NC_012913	T	7	7	2312876	2312882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7623	NC_012913	AGG	2	6	2312928	2312933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7624	NC_012913	ATTGT	2	10	2312950	2312959	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7625	NC_012913	TCA	2	6	2313022	2313027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.